葡萄酒酿造业的社会经济效益较高，气候变化对葡萄树栽培的影响日益受到人们的关注。菌根共生在避免或减少不利天气条件的影响方面的研究大都集中在葡萄的次生代谢过程中，特别是酚类化合物上的Mye因子并激活AM共生的共同共生信号通路（CSSP）。由宿主根释放的独脚金内酯可诱导AM真菌孢子萌发和菌丝生长，使得分枝的真菌菌丝向宿主根生长。一旦生长的菌丝接触根表面，它们就会形成附着枝。随后，植物根表皮细胞经历一系列重编程过程，包括细胞核的运动以及微管和内质网的变化，形成预穿透结构（PPA），引导菌丝破坏根表皮细胞，真菌然后在细胞间生长，最后形成了高度分枝的结构，称为丛枝。高度分叉的丛枝为营养交换提供了大的界面，磷和氮等矿物质营养物质通过共生界面从AM真菌转移到植物宿主。

　　研究表明，葡萄树与AM真菌的结合有利于次生代谢产物白藜芦醇，黄酮醇和花青素等的合成，这不仅增强了植物对环境胁迫的耐受性，而且也是提高浆果质量的决定性因素。最近的一项研究中用AM真菌接种葡萄树，可以改善与葡萄成熟度相关的参数（如花青素含量）和增强抗氧化活性能力，能维持甚至改善浆果质量，因此AM真菌可能在未来的气候变化情景中发挥重要作用。

　　与AM真菌共生的植物中较高浓度的次级代谢产物可能的机制是改善寄主植物的光合作用和矿物质营养，激活次生代谢途径，产生信号分子和激索，促进参与次级代谢基因的大量表达对葡萄树与AM真菌共生研究可知，AM真菌定植的一个明显结果是某些基因表达上调，如营养转运、转录因子和细胞壁等相关基因的基因表达。此外，AM真菌在葡萄树的根中存在激活苯丙氨酸解氨酶和白藜芦醇0-甲基转移酶基因转录的现象并参与了葡萄树对单轴霉的防御反应。

　　2、改善土壤结构减少土壤养分流失

　　AM真菌在自然和农业环境中的重要作用是使土壤结构发生有益改变。高度分枝的AM真菌菌丝体的密集菌丝网络形成了一个三维基质，使土壤颗粒融合并交联而不会压实土壤。土壤蛋白（GRSPs）被确定为土壤团聚体稳定的另一重要因素，球囊霉素是一类土壤蛋白，命名原因是因为它被认为由AM真菌产生球囊霉素不是一种确定的基因产物或化学上同质的分子种类，而是一种土壤的重要组分，由其免疫反应性质决定。最近，球囊霉素在研究中有了新的发现虽然球囊霉素的起源和功能还远未为世人所知，然而，它们代表了土壤质量的重要决定因素。GRSPs占有机土壤碳总量的2%~5%，由于球囊霉素可以通过增加土壤颗粒聚集来保护其他形式的有机碳免于降解，因此它们可能对土壤中碳的封存有显著贡献。总之，AM真菌的菌丝网络不仅对植物生长和根系发育有促进作用，还可以保护土壤免受强风和水流的侵蚀，AM真菌对土壤质量的影响还表现在更强的保水能力上。AM真菌对于干旱地区处于干燥沙质土壤中的植物尤为重要。这些土壤通常表现出低再生率的特征，一旦被破坏难以恢复，而且极易受风雨侵蚀在这种情况下，接种丛枝菌根共生菌可以抵御侵蚀和提高土壤肥力，形成可持续生产方式。

　　丛枝菌根共生除了具有改善土壤结构和保持水土的功能外，还能减少土壤中的养分淋失。营养物浸出会导致土壤肥力的丧失以及地下水和地表水（河流，湖泊）的污染。由于根和土壤微生物（主要是AM真菌）对营养物质的有效吸附和保留，生态系统能表现出良好的营养保持能力农业土壤受到农业活动（特别是犁耕）的人为干扰，接收了大量的肥料，主要是N、P、K。如果缺乏良好的营养保留系统，这些肥料特别是具有高度流动性的硝酸盐，很容易从土壤中冲刷掉。AM真菌对营养物保留在不同程度上发挥有益的作用首先，改良土壤结构，可以增加菌根土壤中微量和大量聚集体的养分螯合作用；其次，AM真菌也可以直接从土壤溶液中吸收养分因此，接种过丛枝菌根的土壤表现出更好的土壤溶液保留能力，同时AM真菌有利于植物对土壤营养和水的吸收利用。研究报道了AM真菌在干旱胁迫下对番茄的营养吸收有益。对于P和N元素，已经有研究证明了接种丛枝菌根真菌后的土壤中这两种营养元素浸出减少。可以推断出丛枝菌根对于其他矿物质营养元素也具有类似的功能AM真菌能通过产生封闭的养分循环，将土壤中的养分通量结合起来，从而促进长期土壤肥力的提高。