微生物有肥料是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。微生物肥料的功效是一种综合性作用，一般不直接为农作物提供营养元素，主要起间接营养的作用。而这些微小的生物是怎样在土壤中起作用的呢？归纳起来主要有如下几方面：

   增进土壤肥力

  这是微生物肥料的主要作用之一。例如各种自生、联合或共生的固氮微生物肥料，可以增加土壤中的氮素含量；多种溶磷、解钾的微生物，如芽孢杆菌、假单胞菌的应用，可以将土壤中难溶的磷、钾分解出来，转变为作物能吸收利用的磷、钾化合物，使作物生长环境中的营养元素供应增加。一些微生物肥料的应用，增加了土壤中的有机质，提高了土壤的肥力。

  微生物菌肥施入土壤后，能快速繁殖并能形成活力强大的益生菌群，从根本上改善了土壤及根系周边的生态结构，使得多年使用化肥板结的土壤疏松透气，吸收空气中的氮并形成“生态氮肥” ，将多年沉积于土壤中的无效死磷死钾激活，让植物根系吸收。

   改良土壤结构

  微生物还能分泌产生大量的胞外多糖类物质，如荚膜多糖、肽聚糖等。研究表明，这些有益微生物产生的糖类物质，占土壤有机质的0.1%，它们能与植物根系分泌物、土壤胶体等共同作用,形成土壤团粒结构。此外，它们还参与腐殖质形成，改善土壤理化性质。

   刺激作物生长

  有些微生物肥料中的微生物还可分泌植物激素类物质、维生素等，刺激和调节作物生长发育。例如，固氮菌等能够产生多种活性物质(生长素、环己六醇、泛酸、吡哆醇、硫胺素等)，固氮菌培养物中可检测到吲哚-3-乙酸；荧光假单孢菌的所有菌株均能产生赤霉素和类赤霉素物质，部分菌株还能产生吲哚乙酸，少数菌株能合成生物素和泛酸；丛枝菌根真菌能诱导牧草植株产生细胞分裂素(CTK)，改变脱落酸(ABA)与赤霉素的比例。

   提高品质早熟高产

  微生物肥料能激发土壤中固定的钾、钙、锌等中微量营养元素。这些元素能供给作物微生物菌肥能产生植物激素类物质刺激作物生长。

  许多用作微生物肥料的微生物还可产生植物激素类物质，能刺激和调节作物生长，使植物生长健壮，营养状况得到改善。一般可使经济作物增产30%以上，大田作物增产7~10%或以上。

  科学家通过研究发现，微生物具有把氮气固定住的神奇功能，能把空气中的自由态氮转化成作物可吸收利用的有效态氮。

  另外，微生物中的磷、钾细菌能分解土壤中固定的磷、钾元素，并把它们释放出来，供作物利用。那些繁殖飞快的有效菌还能刺激作物的生长，起到防病作用。

  于是，科学家选育出能够人工培养的有益微生物，通过工业发酵生产出微生物活体制品,可以直接用于农业生产。

  微生物肥料就是以微生物生命活动导致农作物得到特定的肥料效应，达到促进作物生长或产量增加或质量提高的一类制品。

   增强抗逆性

  微生物肥料除了传统肥料的增产增收效果外，还可以减轻作物病害。这主要有以下三个方面的原因：

  一是肥料中的有益微生物生长繁殖，在作物根际土壤微生态系统内形成优势种群，抑制其他有害微生物的生长繁殖，甚至对部分有害病原菌产生拮抗作用，减少了有害微生物的危害机会。

  二是有益微生物在生长繁殖过程中向作物根际土壤微生态系统内分泌各种代谢产物，这些代谢产物能够刺激作物生长，提高作物抵抗不良环境的能力。

  三是在植物受到病害、冻害、干旱、衰老等逆境时，施用微生物肥料其所含的菌种能诱导作物产生超氧化物歧化酶，消除因逆境而产生的自由基，从而提高作物的抗逆性，减轻病害。

   减少化肥的使用量、提高肥料利用率

  使用微生物肥料后可以减少化肥的施用餐。由于微生物肥料可以提高土壤的养分含量，因此在相同地力水平的土壤上可以减少化肥的用量，并且获得等效的增产效果。微生物肥料在提高肥料利用率方面有明显作用，根据作物种类、土壤类型和气候条件，微生物肥料与化肥的合理配合，既能增加作物产量，又能提高肥料利用率，这不仅有经济上的意义，而且有生态学和环境保护的意义。

  除上述作用外．微生物肥料还具有如下作用：施用后不会造成有害物质在作物体内的积累；对农业生态环境无不良影响，有的还具有土壤净化剂功效，降低土壤中过多积累的有机物质。如分解纤维素、木质素等微生物肥料，可对城市生活垃圾、农牧业有机废弃物进行快速发酵。